बाह्य अंतरिक्ष, सुदूर भविष्य। सौर मंडल के विनाश के दस शताब्दियों बाद, एक अकेला बीज जहाज, सिदोनिया, शून्य में यात्रा कर रहा है। विशाल, लगभग अविनाशी, फिर भी बमुश्किल संवेदनशील विदेशी जीवन के रूप जिन्होंने मानवता के घरेलू संसार को नष्ट कर दिया, वे अस्तित्व के लिए खतरा बने हुए हैं। नगेट तनिकाज़े ने केवल बर्तन की गहराई में चमकते स्तर के नीचे जीवन को जाना है, जहां मनुष्यों ने प्रकाश संश्लेषण और नए लिंग प्राप्त किए हैं। हालांकि, अंडरग्राउंड से बाहर आने के कुछ ही समय बाद, अंतरिक्ष यान की शांत दिमाग वाली महिला कप्तान द्वारा युवा को एक क़ीमती विरासत दी जाती है।
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